法律分析：农村合作医疗的生效时间是从办理参保手续的第二年的年初起至该年度的年末，一整年。农村合作医疗制度，是中国农村社会通过集体和个人集资，用以为农村居民提供低费的医疗保健服务的一种互助互济制度。新型农村合作医疗是以年度为单位办理参合手续，并且在同一个缴费年度内享受该年度的合作医疗报销待遇。所以，农村合作医疗交完相关费用后，从下一年的1月1日开始生效，而不是当天缴费当天生效。法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十五条国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。
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